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近岸丨類器官培養(yǎng)答疑解惑

類器官是能夠在體外三維培養(yǎng),并表現(xiàn)出相應(yīng)器官生物學(xué)特征的“最小系統(tǒng)”。雖然對于類器官的研究日趨成熟,但大家總會有這樣那樣的小困惑:為什么要用上皮細(xì)胞培養(yǎng)?為什么培養(yǎng)基的成分這么復(fù)雜?


今天小編整理了一些關(guān)于類器官構(gòu)建原理方面的問題,希望能夠?qū)Ω魑恍』锇橛兴鶐椭?/span>



Q1: 類器官培養(yǎng)對于起始細(xì)胞的來源有要求嗎?

A1: 目前培養(yǎng)的類器官主要來源于上皮細(xì)胞,對于非上皮細(xì)胞來源的類器官培養(yǎng)方式還需要進(jìn)一步研究。


Q2: 類器官按照起始細(xì)胞的類型,分為幾種呢?

A2: 常見的類器官根據(jù)起始細(xì)胞的類型,可以分為兩種:

(1)腫瘤組織來源的腫瘤類器官;

(2)干細(xì)胞來源的類器官,包括:多能性干細(xì)胞 (PSC) /成體干細(xì)胞 (ASC)以及誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)。


Q3: 類器官是由單一種類細(xì)胞組成的嗎?


A3: 類器官并不是單一細(xì)胞組成的結(jié)構(gòu),而是由具有干細(xì)胞性質(zhì)的起始細(xì)胞進(jìn)行分裂和分化,并將多種類型的細(xì)胞自組裝的結(jié)構(gòu),自組裝后的形態(tài)和功能與體內(nèi)相應(yīng)器官相似。


Q4:在沒有新鮮組織的情況下,可以用凍存組織提取的原代細(xì)胞進(jìn)行3D培養(yǎng)嗎?

A4:可以的。已有學(xué)者驗證過,將人結(jié)腸癌、甲狀腺癌、肺癌、腎癌和肝癌的手術(shù)組織切碎后,以梯度降溫的方式進(jìn)行冷凍,最終在液氮中保存15-18個月后進(jìn)行復(fù)蘇和原代細(xì)胞提取,分別對細(xì)胞進(jìn)行2D和3D培養(yǎng),證實了凍存對于細(xì)胞活力和生長速度均無顯著影響【1】。

當(dāng)然,由于組織來源不同、凍存條件不同,還需要大家根據(jù)實際情況進(jìn)行驗證,新鮮組織提取的細(xì)胞依然是3D培養(yǎng)的最佳選擇。


Q5:類器官可以像細(xì)胞一樣進(jìn)行凍存和復(fù)蘇嗎?

A5:類器官可以凍存,通常會在傳代2-3次之后選擇凍存。為了達(dá)到最佳的效果,可以選擇類器官成熟(傳代7-10次)后再進(jìn)行凍存。


Q6:類器官的尺寸需要進(jìn)行控制嗎?

A6:是的,主要的原因是類器官內(nèi)部缺乏循環(huán)系統(tǒng)。

當(dāng)類器官的尺寸較大時,靠近中心的細(xì)胞難以和外界進(jìn)行氧氣和營養(yǎng)成分的交換。因此這個結(jié)構(gòu)尺寸越大,死亡的細(xì)胞就越多(如圖1)【2】。我們在培養(yǎng)的過程中,需要控制類器官的大小在4-5mm以內(nèi)。未來的類器官技術(shù)可以與血管類器官結(jié)合在一起,建立一個功能性的封閉循環(huán)系統(tǒng),用以培養(yǎng)出更大尺寸的類器官。


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圖1. TUNEL染色表明較大尺寸的類器官中心有大量細(xì)胞死亡(綠色),比例尺為100μm【2】



Q7:類器官傳代的標(biāo)準(zhǔn)是什么?

A7:類器官的傳代通常是根據(jù)培養(yǎng)的時間判斷。一般在7-14天時進(jìn)行第一次傳代,后續(xù)則每7-10天傳代一次【3】



Q8:類器官可以進(jìn)行多少次傳代?

A8:大部分類器官可以在體外連續(xù)傳代10次(>6個月),甚至有些類器官可以連續(xù)傳代20次(>12個月)并且維持原有的生長速度【4】。


Q9: 鑒定類器官的方法有哪些?

A9: 初步可以通過顯微鏡和H&E染色觀察形態(tài);然后可以用Western Blot、qRT-PCR、免疫熒光、流式細(xì)胞術(shù)檢測該類器官是否表達(dá)相應(yīng)的biomarker;基因測序可以鑒定所培養(yǎng)的類器官是否有某些特征丟失;對于部分類器官,還可以檢測其是否具有功能,例如:已有研究檢測出胃類器官可以分泌胃酸,心臟類器官可以自主跳動。


Q10: 類器官是如何按照我們的意愿進(jìn)行定向分化的?

A10: 在進(jìn)行類器官培養(yǎng)前,我們需要了解該器官在體內(nèi)的發(fā)育過程,及早期發(fā)育相關(guān)的信號通路。

以胃類器官培養(yǎng)為例:胃由前后腸發(fā)育而來,早期發(fā)育需要由多種信號通路共同調(diào)控。那么在體外我們需要通過添加細(xì)胞因子的方式,指導(dǎo)激活/抑制相應(yīng)的信號通路,來達(dá)到相同的效果,如:PSCs在Activin A的作用下分化為內(nèi)胚層,Wnt3a、FGF-4和Noggin指導(dǎo)細(xì)胞向向前腸分化【5】。



類器官是能夠在體外三維培養(yǎng),并表現(xiàn)出相應(yīng)器官生物學(xué)特征的“最小系統(tǒng)”。隨著類器官培養(yǎng)技術(shù)的不斷進(jìn)步,應(yīng)用也越來越廣泛。

今天小編整理了一些關(guān)于類器官應(yīng)用方面的問題,希望能夠?qū)Ω魑恍』锇橛兴鶐椭?/span>



Q1:用于疾病研究的類器官需要最大限度減小差異。但在實際培養(yǎng)過程中,同批次類器官個體之間、以及不同批次類器官樣本之間均存在顯著差異,這個問題怎樣克服呢?

A1: 類器官是由不同類型的細(xì)胞組成的結(jié)構(gòu),并且在體外是自組裝的,因此很容易存在同一樣本在相同培養(yǎng)條件下的孔間差異。

如果是用于患者個性化醫(yī)療的腫瘤類器官,需要更精準(zhǔn)地模擬患者體內(nèi)的特征,這種情況建議采用多個平行來減小差異;

如果是用于機(jī)制研究或用作疾病模型的類器官,可以考慮利用“微流控液滴技術(shù)”進(jìn)行工程化培養(yǎng),相關(guān)成果已發(fā)表在Cell Reports Medicine【1】


Q2: 目前培養(yǎng)出的類器官可以進(jìn)行體內(nèi)移植,用于器官重建嗎?

A2:已有動物實驗證實過可行性,比如:腸類器官移植小鼠治療潰瘍性結(jié)腸炎【2】;胰島類器官移植小鼠治療糖尿病【3】

雖然目前類器官移植尚未進(jìn)入臨床,但在2021年2月,Science【4】首次報道了利用膽道類器官修復(fù)離體條件下的人類肝臟,實現(xiàn)了膽道再生,并改善了膽汁性質(zhì)。


Q3:類器官一般長到什么程度可以用來進(jìn)行藥物測試?

A3:這個問題可以在Nature Protocols【5】找到答案。

對于新鮮培養(yǎng)的類器官:建議對低代次類器官(2-3代)進(jìn)行藥物篩選,以最大限度地減少使用過的培養(yǎng)基或體外突變累積對藥物測試的影響。

對于經(jīng)過凍存的類器官:由于冷凍/解凍可能導(dǎo)致復(fù)蘇時器官樣形態(tài)的變化,因此建議類器官至少傳代一次再進(jìn)行藥物篩選。如果出現(xiàn)復(fù)蘇后細(xì)胞活力不佳,則需要延長培養(yǎng)時間以恢復(fù)細(xì)胞狀態(tài)。


Q4:類器官建立是否成功有怎樣的標(biāo)準(zhǔn)嗎?

A4:1、判斷形態(tài)。顯微鏡下類器官形態(tài)可能為空泡狀、出芽狀、緊密型、松散型等,但整體形態(tài)一致。

2、可以鑒定相應(yīng)的biomarker是否有表達(dá),及分布是否與組織切片相似。

3、是否能夠傳代3次以上,并可以凍存復(fù)蘇。

4、如果有條件的話,可以進(jìn)行測序分析。


Q5:類器官可以進(jìn)行基因編輯嗎?

A5:可以,干細(xì)胞來源類器官的基因編輯多用于疾病建模,而腫瘤來源的類器官則多用于尋找疾病相關(guān)突變點(diǎn)或治療靶點(diǎn),圖1列舉了類器官基因編輯的部分研究和應(yīng)用。


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圖1.類器官基因編輯的部分研究和應(yīng)用【6】


Q6:類器官培養(yǎng)和普通細(xì)胞培養(yǎng)有何不同之處?

A6:1、細(xì)胞來源有區(qū)別:類器官的細(xì)胞來源是具有多能性的上皮細(xì)胞,而普通細(xì)胞培養(yǎng)適用于培養(yǎng)多種類型細(xì)胞;

2、 細(xì)胞培養(yǎng)方式不同:1)類器官需要基質(zhì)膠等材料支撐其三維結(jié)構(gòu),普通細(xì)胞培養(yǎng)則不需要;2) 類器官需要實現(xiàn)體外分化和自組裝,因此需要多種細(xì)胞因子的組合進(jìn)行誘導(dǎo),培養(yǎng)基成分復(fù)雜。而普通細(xì)胞培養(yǎng)通常為單一種類細(xì)胞,因此培養(yǎng)基成分較簡單;



Q7:用哪種培養(yǎng)基培養(yǎng)來自轉(zhuǎn)移部位腫瘤的類器官,比如原發(fā)灶為A類型腫瘤,轉(zhuǎn)移灶為B類型腫瘤?

A7:通常來講,如果腫瘤發(fā)生了轉(zhuǎn)移,我們依然選用相對應(yīng)的原發(fā)灶(A類型)PDO培養(yǎng)基。


Q8:怎樣證明培養(yǎng)出的結(jié)構(gòu)是類器官,而不是簡單聚集在一起的細(xì)胞團(tuán)?

A8:類器官的分化方式本質(zhì)上是在模擬體內(nèi)的器官發(fā)育,因此表達(dá)形態(tài)及各細(xì)胞分布情況與實際器官具有相似性,而細(xì)胞團(tuán)則沒有這種規(guī)律。我們可以通過免疫熒光的方式檢測biomarkers的分布情況來區(qū)分。例如下圖中的結(jié)果表明,腎類器官與腎組織的biomarkers分布高度一致【7】。


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圖2. 腎類器官與腎組織的biomarkers分布高度一致【7】



Q9:類器官的的來源細(xì)胞必須要具有多能性嗎?正常組織成熟體細(xì)胞可以進(jìn)行類器官培養(yǎng)嗎?

A9:由于類器官涉及到體外分化和自組裝,因此來源細(xì)胞必須具有多能性。正常組織的成熟體細(xì)胞中往往會有一部分成體干細(xì)胞(標(biāo)志物為Lgr5,CD133等),這部分細(xì)胞也可以進(jìn)行類器官培養(yǎng)。



Q10:可以通過構(gòu)建條件性培養(yǎng)基代替商品化的細(xì)胞因子嗎?

A10:依據(jù)Hans Clevers實驗室早期發(fā)表的文章,可以采用條件性培養(yǎng)基代替純化的細(xì)胞因子進(jìn)行類器官培養(yǎng),但同時也需要考慮條件性培養(yǎng)基的不足之處。小編總結(jié)了條件性培養(yǎng)基和近岸細(xì)胞因子的參數(shù)差異。


表1. 條件性培養(yǎng)基和近岸蛋白細(xì)胞因子的參數(shù)差異


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總的來說,條件性培養(yǎng)基對于部分預(yù)實驗或少量類器官培養(yǎng)是可行的,但鑒于質(zhì)粒構(gòu)建和驗證消耗的時間,以及檢測過程涉及的抗體、qPCR等成本也是需要考慮在內(nèi)的。同時,細(xì)胞代謝產(chǎn)物、內(nèi)毒素和宿主殘留物等也有可能影響實驗結(jié)果。因此,選用高品質(zhì)的商品化細(xì)胞因子能夠幫您節(jié)約時間和金錢成本,快速推動類器官培養(yǎng)進(jìn)程。


類器官是能夠在體外三維培養(yǎng),并表現(xiàn)出相應(yīng)器官生物學(xué)特征的“最小系統(tǒng)”。雖然許多類器官的培養(yǎng)方案日漸成熟,但在實際操作中總會碰到這樣那樣的問題。

今天小編整理了一些類器官培養(yǎng)操作中常遇到的問題,希望能夠?qū)Ω魑恍』锇橛兴鶐椭?/span>


Q1: 按照文獻(xiàn)方法進(jìn)行類器官培養(yǎng),為什么觀察到的形態(tài)卻和文獻(xiàn)不一致?


A1:決定類器官形態(tài)的因素有很多,樣本來源是否相同、選用的細(xì)胞因子品質(zhì)是否有差異都有可能改變最終的類器官形態(tài)。這里舉一個文獻(xiàn)中的例子,分別取四個高級別漿液性(HGS)卵巢癌患者的腫瘤組織,用同樣的條件進(jìn)行類器官培養(yǎng),H&E染色結(jié)果顯示它們的形態(tài)千差萬別【1】。因此對于類器官的鑒定,我們不能局限于形態(tài)觀察,需要使用多種方法相結(jié)合。


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圖1. 由4例HGS卵巢癌患者的腫瘤組織所制備的類器官形態(tài)不同【1】



Q2:類器官的藥敏實驗中需要使用DMSO作為藥物的溶劑,需要控制DMSO的用量嗎?

A2:考慮到DMSO這類有機(jī)物的細(xì)胞毒性,建議終濃度不超過0.1%(v/v)。



Q3:培養(yǎng)過程中發(fā)現(xiàn)類器官培養(yǎng)物中有黑色小顆粒,這個是雜質(zhì)嗎?應(yīng)該怎樣去除?

A3:黑色小顆粒大概率是雜質(zhì)或細(xì)胞碎片,去除它們有以下兩種方式可以參考:

1、將類器官消化下來,用培養(yǎng)基進(jìn)行反復(fù)清洗,達(dá)到稀釋雜質(zhì)的作用;

2、用無菌手術(shù)刀將類器官切成兩半,取1ml注射器吸滿培養(yǎng)基并輕輕推出,沖洗類器官中的雜質(zhì)【2】


Q4:對于腫瘤患者的個性化醫(yī)療測試,PDO、PDX、PDXO的模型可以相互結(jié)合使用嗎?

A4:PDO、PDX、PDXO模型有各自的優(yōu)勢,通常有以下兩種結(jié)合方式:PDO-PDX和PDX-PDXO。

1、PDO-PDX是性價比更高的方式,即:先利用PDO進(jìn)行高通量的藥物篩選,篩選出有效的藥物再進(jìn)行PDX測試。

2、PDX-PDXO是更精準(zhǔn)的藥物測試方式,即:先利用PDX產(chǎn)生大量的體內(nèi)腫瘤,然后將這些腫瘤分離進(jìn)行PDXO培養(yǎng),此時可以通過PDX模型,將PDXO的藥敏實驗結(jié)果與體內(nèi)用藥結(jié)果一一對應(yīng),進(jìn)而預(yù)測人體用藥的結(jié)果,實現(xiàn)對患者更精準(zhǔn)的用藥指導(dǎo);并且可以用PDX模型將轉(zhuǎn)移后的腫瘤分離,同樣進(jìn)行PDXO培養(yǎng)和用藥,能夠更精確地對轉(zhuǎn)移灶進(jìn)行藥物篩選。


Q5:類器官怎么從基質(zhì)膠中回收?

A5:1、將類器官放置在冰上,待基質(zhì)膠融化后離心進(jìn)行回收,這種方式適用于不需要將類器官結(jié)構(gòu)完全打散的情況;

2、市售的細(xì)胞回收液,可以溫和有效地獲得細(xì)胞懸液,不會損傷細(xì)胞或細(xì)胞表面蛋白。


Q6:為什么用基質(zhì)膠來培養(yǎng)類器官?可以用其它類型的凝膠替代嗎?

A6:基質(zhì)膠能夠為類器官提供支撐作用,目前類器官培養(yǎng)用的基質(zhì)膠來源于小鼠肉瘤的基底膜基質(zhì),其中含有約60%層粘連蛋白、30% IV 膠原和8%的巢蛋白,還含有基底膜聚糖、TGF-?、表皮生長因子、類胰島素生長因子、組織纖溶酶原等1800多種獨(dú)特的蛋白質(zhì)。由于基質(zhì)膠中各因子的不確定性,并且存在批次間差異,因此目前也有一些聚焦于基質(zhì)膠替代方案的研究,如圖2【3】。


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圖2.基質(zhì)膠的三種替代方案【3】。(a)去細(xì)胞外基質(zhì)和其他衍生蛋白質(zhì),(b)合成水凝膠,以及(c)工程重組蛋白凝膠



Q7:怎樣確定某一種類器官的培養(yǎng)方式更適用于基質(zhì)膠包埋法還是氣-液交互法呢?

A7:1、根據(jù)所模擬的器官自身生長情況選擇,例如:皮膚的正常生長是有一面需要接觸空氣,那么對于皮膚類器官的培養(yǎng)傾向于利用氣-液交互法來培養(yǎng)【4】;

2、考慮所培養(yǎng)的類器官模型的應(yīng)用方向,例如:氣-液交互法培養(yǎng)易于進(jìn)行病毒感染實驗,因此用于病毒感染實驗的氣道類器官會優(yōu)先選擇氣-液交互法培養(yǎng)【5】。



Q8:在進(jìn)行藥敏實驗前,類器官的接種方式是怎樣的呢?

A8:藥物篩選前,通常將類器官吹散后,用含2%-5%基質(zhì)膠的培養(yǎng)基懸浮,并最終鋪在基質(zhì)膠包被的孔板中【6-7】。


Q9:在離心回收時,會有很多類器官粘附在離心管壁,有沒有更好的辦法提高回收率?

A9:建議采用水平轉(zhuǎn)子代替角轉(zhuǎn)子,可以有效減少類器官掛在離心管壁的情況。


Q10:利用腫瘤類器官模型進(jìn)行篩選的藥物有什么局限性嗎?

A10:1、抗體藥物因為需要免疫細(xì)胞的參與,因此腫瘤類器官不能篩選抗體類藥物,此類藥物篩選需要構(gòu)建腫瘤類器官-腫瘤微環(huán)境的模型來實現(xiàn);

2、由于腫瘤類器官中沒有對血管進(jìn)行培養(yǎng),因此抗血管類的藥物也同樣不能進(jìn)行篩選。




近岸蛋白自主研發(fā)生產(chǎn)的低內(nèi)毒素Activin A、FGF系列、HGF、R-Spondin 1、Noggin和Wnt3a等細(xì)胞因子,內(nèi)毒素低至<10EU/mg,具有高活性、高純度、高批間一致性,為類器官培養(yǎng)設(shè)計,已獲得市場認(rèn)可,讓您研究放心!


目錄號

產(chǎn)品名稱

C687

Human/Mouse/Rat Activin A

C076

Human/Mouse/Rat BDNF

C012

Human/Mouse/Rat BMP-2

C688

Human DKK1 (N-8His)

C029

Human EGF

CH28

Mouse EGF (C-6His)

C779

Human FGF basic/FGF-2

C044

Mouse FGF basic/FGF-2

CR08

Human FGF-4

CR66

Mouse FGF-4

CH73

Human FGF-7/KGF

C198

Human FGF-9

CR12

Mouse FGF-9 (N-6His)

CR11

Human FGF-10

CG74

Human FGF-19

C226

Human GDNF

CJ72

Human HGF (C-6His)

CC13

Mouse HGF (C-6His)

C017

Human LIF

C690

Mouse LIF

CB89

Human Noggin

C028

Mouse Noggin(C-6His)

C753

Human NRG1-beta 1

C079

Human NT-3

C099

Human OSM (N-6His)

C736

Human Prolactin/PRL

CX83

Human R-Spondin 1 (C-6His)

C18C

Human R-spondin 3 (C-6His)

C100

Human Shh

C089

Human Shh (C24II)

CH69

Mouse Shh

CH66

Mouse Shh(C25II)

CA59

Human TGF-beta 1

C06D

Human Wnt3a

C18K

Human Wnt3a V2


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